尖锐湿疣的治疗盲目地抗病毒治疗，一味地追求多疗程治疗。目前某些性病防治机构，动不动就让病人一个疗程又一个疗程的使用广谱抗病毒药物，比如阿昔洛韦等，还有如病毒唑、聚肌胞之类，其实这些抗病毒的广谱药物仅对疱疹病毒疗效是比较肯定的，而对尖锐湿疣病毒没有特异性，疗效很差。

在增强机体的免疫力上下了很大的功夫，大剂量多疗程地使用免疫增强剂;实际上尖锐湿疣病毒在临床上引起的感染只局限于局部的皮肤粘膜组织，不至于引起机体的全身免疫力降低。对尖锐湿疣实际上起到作用的是局部细胞免疫，而不是全身免疫，但目前使用的免疫增强剂的药理作用主要是增强全身免疫，所以对尖锐湿疣治疗的作用不是很强。