通过不洁性交或间接接触的方式，感染了人类乳头瘤病毒，病毒感染人体后，潜伏在外生殖器的基底角朊细胞间，潜伏期一般1-6个月，平均3个月。以后随表皮细胞层复制，人类乳头瘤病毒侵人细胞核，引起细胞迅速分裂，同时伴随着病毒颗粒的繁殖与播散，形成特征性的乳头状瘤，表现为形态各异，大小不一的赘生物。 尖锐湿疣的病原体为人类乳头病毒，传染源主要是患有尖锐湿疣的病人，传播途径主要有以下几种：

(1)直接性接触传染：这是最主要的传播途径。与患有尖锐湿疣的病人性交时，生长在外生殖器部位的疣体，由于呈外生凸出而且质地比较脆，故表面容易擦破，疣体及表皮组织内的病毒随之脱落接种到性交伴侣的生殖器上，导致人类乳头瘤病毒的感染而发病。所以，尖锐湿疣在性关系比较混乱的人群中很容易发生。

(2)母婴传染：患有尖锐湿疣的孕妇，尤其是临床症状不明显而子宫颈部位有病毒感染的孕妇，生殖道内会有病毒，分娩时，胎儿经过产道，导致新生儿的病毒感染，引起婴幼儿患尖锐湿疣。

(3)间接传播：部分尖锐湿疣病人感染人乳头瘤病毒是通过间接的途径，最常见者为日常生活用品如内裤、浴巾、浴盆等。因此，外出、旅游者对此途径应引起高度重视。