本病发生原因可分为两类：其单纯性或非感染因素，其感染性或可传染性疾病，前者除生理性包茎包皮过长性成熟以后，包皮垢刺激或少数机械怀损伤因素，而发生龟头红肿灼热的炎症改变。后者除非感染因素所致的包皮龟头炎，均属之亦就是病原微生物为主导因素，所引起的包皮龟头炎其中以细菌性与真菌性感染为最常见。   

感染性男性包皮龟头炎的病原菌，除少数毒素强的细菌（如淋菌）外大多都为非致病性微生物或低毒细菌。往往在条件具备情况下，可成致病因素故亦称条件致病菌引起的疾病。   

引起包皮龟头炎的条件致病菌中以真菌毛滴虫或某些厌氧菌最多见。对于患包皮龟头炎的病人来说。这类致病菌来源多为外感所致。即就是性伴带菌而传给男性遇到适宜的机体条件而发病。   

条件致病菌不少以女性阴道为孳生地，可因女性每月内分泌变迁影响阴道PH条件。有利于这类寄生菌活跃繁殖数量增多，成为发病要素。产生局部搔痒灼热粘膜红肿充血，甚而可使粘膜发疹或糜烂。随之刺激阴道分泌物增多，微生物（真菌或滴虫）的产物假膜形成。絮状白带或泡沫样分泌溢出，腥臭味日渐增重。在女性阴道微生物繁殖期间，男女性交极易成为男性被感染的机会。导致包皮龟头炎的发生感染，局部产生红肿发疹糜烂渗液及灼热发痒系列症状 。