生殖器疱疹主要是通过性器官接触而传染的，病人和无症状的带病毒者是主要传染源。在成人中，生殖器疱疹病毒抗体的阳性率较高，生殖器疱疹分为原发性的生复发性两种。

原发指首次感染病毒，一般从接触到发病约2-10天，也就是潜伏期。患病部位先有烧灼感，很快在红斑基础上发生3-10个成群的红色丘疹，伴有瘙痒，丘疹很快变成小水疱，3-5天后变为脓疱，破溃后形成大片的糜烂和溃疡，自觉疼痛，最后结痂愈合。整个病程可持续20天左右。在男性好发于龟头、冠状沟、尿道口、阴茎、阴囊、大腿和臂部等处。女性好发于阴唇、阴阜、阴蒂、肛周或阴道。约90%的病人，病毒可同时侵犯子宫颈，出现阴道分泌物增多或下腹痛，并可并发宫颈炎和子宫炎。大多数男女病人双侧腹股沟淋巴结肿大。后期炎症波及尿道、膀胱时，可出现排尿困难、尿痛、尿频、严重者可发生尿潴留等现象。此外，还可能有其它症状同时出现。此病女性多于男性，症状也较男性严重。