现在治疗性功能障碍的治疗方法较多，不少患者能获得较好的疗效。进行心理治疗或咨询时，医生应公开、坦率地谈论性的问题，应以恰当的方式询问，使用患者可接受的语言(避免用难懂的术语或较庸俗的语言)，详细了解患者的个人史，了解早期的性经验、性知识的掌握情况、过去和现在的性行为以及夫妻关系等。

应根据患者的具体情况进行相应的性教育，纠正不正确的观念和态度。应使患者了解有关性功能障碍的知识，帮助患者分析症状产生的原因和条件，并进一步寻找解决问题的办法。特殊的心理疗法可采用行为疗法(或认知行为疗法)、分析性心理疗法及催眠疗法等。常采用个体治疗和成双(夫妻)治疗相结合的形式。

行为疗法治疗性功能障碍是当今主要的治疗方法(Masters和Johnson，Singer-Kaplan，Arentewicz 和Schmidt倡导的)。此类方法是以指导和练习为主(性技术的学习和训练)，需要夫妻或伴侣双方共同配合治疗。治疗时首先要详细了解病史、分析患者的行为，然后逐步进行分等级的训练(具体过程和细节见相关的参考文献)。在行为治疗的同时，也可采用精神动力学的方法处理患者的心理冲突。