如果存在有包皮过长与包茎，阴茎头无法显露，那么就会引起种种后患。如：包皮阴茎头炎、慢性尿道炎、膀航炎、肾盂肾炎、阴茎癌等。 和人体各部位皮肤会分泌皮脂一样，包皮的皮脂腺也会分泌皮脂。由于包皮过长或包茎时包皮不能向上翻起，因此这些皮脂便积聚在包皮的内面与阴茎头之间的空隙中，同时尿液也会渗入这个空隙，与这些皮脂发生化学反应，变成了包皮垢，并产生奇臭。长期积存的包皮垢会变成坚硬块状，使人误认为是生了什么瘤子。包皮垢是一种化学性致癌物质，不少实验证实，它有强烈的致癌作用。如将马的包皮垢接种子小鼠体内，可使之产生皮肤的恶性肿瘤。用人的包皮垢接种给小鼠，也可诱发雌鼠的子宫头癌。

对女性也极为不利，丈夫包皮过长，性交时包皮垢进入女性生殖道，多次长期慢性刺激子宫颈，可能诱发宫颈癌。医学调查发现，犹太人的男婴出生后即切除包皮的人群中，妇女子宫颈癌发病率极低。有调查发现，未切除包皮者的妻子与做过包皮环切术者的妻子对比分析，前者子宫颈癌发病率比后者高8倍。