子宫内膜异位症的临床表现，常因病变部位不同而出现不同的临床症状，主要表现为周期性发作。无症状者约为20%左右。还有的可能有别的表现。一般的表现如下：

1、痛经是子宫内膜异位症的典型症状，以继发性，渐进性痛经为特点。痛经大多发生在经前、经期，多为经前1-2天，经期第一天最剧，月经于净后疼痛缓解以致消失，疼痛多位于下腹部和腰骰部，可放射至阴道、会阴、肛门、大腿，疼痛程度与病灶大小不一定成正比。如异位内膜累及子宫直肠及子宫直肠后陷 及子宫股骨韧带时，多有性交痛和肛门附胀感，经期尤甚。

2、不孕：内膜异位患者不孕率达60%以上，可能与盆腔结构的改变、卵巢激素的变化、自身免疫应有关、较正常妇女不孕率高3倍多。

3、肠道或泌尿道症状， 异位病灶累及直肠、乙状结肠、膀胱、输尿管时，可出现排便困难、腹泻、便秘、甚至周期性便血、尿频、尿急、血尿等症状。

4、月经失调：少数患者可能出现经量增多，经期延长或月经紊乱。急腹痛，若卵巢内膜异位囊肿破裂，则可出现急腹痛，多发生于月经期，可伴恶心呕吐和肛坠胀感。有时经量增多或经期延长，亦可有经前点滴出血。

妇科检查：子宫多后倾固定、子宫一侧或双侧附件处扪及与子宫相连的不活动囊块，有压痛，子宫骶骨韧带、子宫后壁或陷凹处有米粒至蚕豆大小不规则的结节，触痛明显，如阴道直肠隔受累，可于阴道后穹窿部触及甚至看到突出紫蓝色结节。