器质性病变引起的阳痿主要表现为生殖器官的器质性病变，包括睾丸发育不良、阴茎发育异常、尿道畸形、阴茎纤维海绵体炎、泌尿生殖系统感染、阴茎持续勃起、阴茎损伤等，该类疾病由于生殖器的器质性病变，影响到阴茎的正常勃起、射精，使性交难以正常进行，可以通过手术矫正及相应的药物治疗，一般疗效较好，但对于一些先天性生殖器的器质性病变，由于时间较长，见效甚微。

除生殖系统的器质性病变以外，还有一些全身性疾病可导致阳痿，如：内分泌系统疾病，包括：糖尿病、性腺功能低下症、甲状腺功能低下、甲状腺功能亢进、皮质醇增多症、慢性肾上腺皮质功能不全、睾丸绒毛膜上皮癌、睾丸间质细胞瘤、肾上腺皮质腺癌及下丘脑一垂体病变。此外神经系统疾病和损伤也可以导致性功能障碍，包括性欲减退、阳痿、延迟射精或不射精等。慢性肾、肝脏功能衰竭、心血管疾病、慢性阻塞性肺病都能影响性能力。临床上病人的心理精神因素的影响导致性功能低下的情况常常可见到。

此外，营养不良、贫血、微量元素尤其是锌的缺乏均可影响性功能，导致阳痿的产生。